Свою историю библиотека ведет с 1919 года, когда на заседании клубной коллегии при Президиуме Московского Совета рабочих и красноармейских депутатов 5 апреля 1919 года было принято решение о «закупке книг для библиотеки «Сущевско-Марьинского» клуба, которая впоследствии получила имя Ивана Захаровича Сурикова. В основу формирования фондов легли так же частные собрания. В 1920 году начало функционировать детское отделение, которое в 1921 году стало самостоятельной детской библиотекой № 2 им. И.З. Сурикова. За свою почти вековую историю библиотека несколько раз меняла адреса и номера. В настоящее время в состав Центральной детской библиотеки № 46 им. И.З. Сурикова входят три библиотеки, расположенные по разным адресам, две из которых обслуживают детское население, одна – взрослое.

В библиотеке работают кружки и клубы по интересам, проводится большое количество культурных и просветительских мероприятий. За регулярную работу по экологическому просвещению школьников библиотеке присвоен сертификат «Зеленая библиотека». Традиционным стал библиотечный марафон «День Наума Грамотника». В рамках мемориальной деятельности реализован экскурсионный проект «Суриковская Москва». Ежегодно библиотека выступает автором инновационных проектов для детей и юношества. Среди гостей там часто можно увидеть известных детских писателей и поэтов. В библиотеке имеется выставочное пространство, организовано несколько детских игровых зон.